一个在线工具可以帮助研究人员合成数百万个分子

酶是引起化学反应的物质。某些类型的酶，如聚酮化合物合酶和非核糖体肽合成酶，具有改组其部分的能力，从而使它们能够产生新的化学物质。如果科学家能够了解这些酶如何改组它们的部分，他们就能了解如何使用它们来合成数百万个分子，例如药物和生物燃料。然而，对这些酶进行工程改造很困难，因为科学家们并不完全了解它们的工作原理。

在NucleicAcidsResearch上发表的一项新研究中，研究人员描述了他们对在线工具ClusterCAD所做的改进，该工具可帮助科学家设计和测试酶的工程变体。

对这些关键酶进行工程改造以生产化学品已成为合成生物学的主要焦点。ClusterCAD是唯一可用的工具，可帮助研究人员为合成生物学应用设计这些酶。研究人员对该工具所做的更改包括扩展的数据库、强大的搜索工具以及界面中有用的新功能。这些更新将扩大科学家可以使用ClusterCAD设计的酶获得的化学物质类型。

ClusterCAD是一个免费的在线平台，可简化为合成生物学应用设计和测试工程化酶变体的过程。该工具允许用户浏览聚酮合酶(PKS)和非核糖体肽合成酶(NRPS)基因簇，它们是编码可产生化学物质的途径的基因组。

通过此次更新，用户现在可以在平台内设计NRPS集群。研究人员还扩展了该平台的集群数据库，使其更加全面和信息丰富。其他更新为用户提供更多可用于研究的高质量集群、扩展的PKS和NRPS工程起点，以及改进的数据库通用性和搜索工具。这些更新允许用户探索更多可通过PKS和NRPS工程生产的化学品。