遗传学研究揭示IBD的健康差异

全基因组测序技术的出现促使人们对遗传学与疾病风险之间的关系进行了大量研究。但绝大多数遗传学研究都是针对欧洲血统的人进行的，遗传学研究人员已经意识到，为了解决健康差异，还需要做更多的工作。

在一项新的研究中，佐治亚理工学院的研究人员调查了25 种已知与炎症性肠病 (IBD) 相关的罕见基因变异是否会影响非裔人的患病风险。虽然最近在欧洲血统的个体中发现了罕见变异关联，约占病例的 15%，但尚不清楚这些相同的罕见基因变异是否以及如何影响非裔人的风险。

这项研究由生物科学学院摄政教授兼汤姆和玛丽·巴顿主席格雷格·吉布森领导，强调了在遗传学研究中考虑遗传多样性和血统混合的重要性。研究结果发表在《基因组医学》杂志上。

“由于过去十年的重大进步，我们现在知道，就遗传学而言，大多数疾病比我们最初想象的要复杂得多，”兼任佐治亚理工学院综合基因组学中心主任的吉布森说。“了解遗传差异是否会导致健康差异是当前遗传学研究的一个主要焦点，我们有机会通过这项研究来检验一个想法。”

如今，非裔人各种类型 IBD 的患病率与欧洲裔人相似。但进展往往更糟：非裔人更有可能进展为需要结肠切除术和其他主要干预措施的严重疾病。

考特尼·阿斯托雷，博士 吉布森实验室的学生和该论文的第一作者，想要评估这些相同的罕见变异是否会对非裔人的 IBD 风险产生类似的影响。Gibson 的实验室与埃默里大学的 Subra Kugathasan 和 NIH 的 IBD 遗传学联盟合作，分析了 3,000 多个非洲裔人的完整基因组序列，其中一半患有 IBD。阿斯托使用该数据库进行分析。

她首先绘制了罕见变异的频率差异，并很快意识到非洲裔人中这些变异的流行率显着下降。通过进一步的计算，她估计欧洲血统变异实际上对非裔人 IBD 的影响非常小(每 10 万人中大约有 44 例额外病例)，比欧洲血统人少四倍。

“在我们进行分析之前，我们怀疑混合物可能在非裔人中存在 IBD 相关罕见变异中发挥作用，”Astore 说。“当我看到这些差异时，我意识到其中有一些重要的东西需要我们去发现。”

然后，阿斯托尔使用了一种称为染色体绘画的方法，这是一种可视化基因组每个片段来自何处的工具。她表明，在非裔人中发现的罕见变异几乎总是位于欧洲血统基因组的片段上。

简而言之，变异的位置表明这些基因是混合的结果——混合是一个科学术语，表示整个祖先的遗传背景混合——这使得阿斯托尔能够证明这些突变出现在非洲以外的地区，并且只开始出现在非洲人身上。过去十几代都有非洲血统。

为了总结这项研究，吉布森和阿斯托评估了与十几种其他疾病相关的其他罕见变异的存在，这同样证实了这些变异的存在通常通过混合对非裔人产生影响。

出于多种原因，这些发现很重要。首先，他们强调了在所有遗传学研究中考虑遗传多样性和混合的价值，特别是在研究罕见变异及其与复杂疾病的关联时。虽然他们表明欧洲变异在非裔人中很少见，但几乎可以肯定，有一些罕见的变异会导致非裔人的炎症性肠病，这些变异尚未被发现，并且可能指向生物学机制。

“对不同人群，尤其是混合人群进行更多的基因研究，对于治疗发现至关重要，”阿斯托尔说。

精准医学最终将根据个人基因组进行定制，这意味着在某些情况下了解罕见变异的身份将有助于指导治疗。如果是这样的话，了解祖先的背景将会很有帮助。这也意味着，如果不对不同的血统群体进行更多研究，那么新的治疗方法可能不会对所有人都有效。该团队还强调，遗传学并不是导致 IBD 等复杂疾病风险的唯一因素，他们的研究只是强调，不能假设遗传发现是所有人的风险因素。

吉布森说：“我们的研究强调，为了朝着更大的健康公平方向前进，对非裔人和所有血统群体进行大规模基因测序绝对至关重要。” “我们希望我们的工作能够鼓励对健康的社会决定因素和跨血统的 IBD 遗传学进行更多研究。”