让免疫疗法更安全

休斯顿大学的研究人员正在努力使 T 细胞免疫疗法更安全，他们开发了一种名为 CrossDome 的工具，该工具结合遗传和生化信息来预测 T 细胞免疫疗法是否会错误地攻击健康细胞。

基于 T 细胞的免疫疗法在抗击癌症和传染病方面具有巨大潜力，这要归功于它们能够特异性靶向病变细胞，包括癌症转移。然而，这种潜力已因安全问题而有所缓和，即可能识别健康细胞显示的未知脱靶。

在一个案例中，科学家们创造了特殊的 T 细胞，这些 T 细胞应该靶向一种在称为黑色素瘤的皮肤癌中发现的蛋白质。然而，这些 T 细胞最终也攻击了一些患者心脏细胞中发现的另一种蛋白质。这对心脏造成了严重的伤害。

“我们的 CrossDome 工具有助于预测基于 T 细胞的免疫疗法的潜在风险。它使用不同类型的信息(称为多组学)的组合来进行预测并确定治疗是否可能意外伤害健康细胞除了针对预期的患病细胞之外，“计算生物学助理教授兼成员 Dinler Antunes 说。核受体和细胞信号转导中心。他的工作发表在Frontiers in Immunology上。“通过分析各种因素，CrossDome 提供了对基于 T 细胞的免疫疗法安全性的见解，并可能帮助研究人员开发更安全的治疗方法。”

为了测试 CrossDome 的有效性，Antunes 和 Altunes 实验室的博士后研究员 Andre F. Fonseca 用它来预测 16 个著名的 T 细胞交叉反应案例中的潜在错误，包括黑色素瘤-心脏损伤案例。该工具成功地将心脏蛋白识别为 T 细胞的潜在目标，将其列为数千种其他蛋白质中的高风险候选者。

为了加强结果，Antunes 结合了来自不同功能数据集的信息，以帮助评估某些基因的表达量以及它们与称为 HLA 的特定分子结合以触发免疫反应的可能性。

“这些信息帮助我们决定哪些潜在的脱靶基因值得在实验中进行测试，”Antunes 说。

CrossDome 用户可以是技术人员也可以是非技术人员。它的功能允许知道如何编码的人进行更高级的控制，并为没有编码经验的人提供易于使用的界面。