单细胞转录组学分析揭示了多样化和动态的衰老细胞群

一篇新的研究论文发表在Aging杂志上(被 MEDLINE/PubMed 列为“Aging (Albany NY)”和“Aging-US”，被 Web of Science 列为“Aging (Albany NY)”和“Aging-US”)第 15 卷第 8 期，题为，“单细胞转录组学分析揭示了多样化和动态的衰老细胞群。”

衰老是由亚致死细胞损伤引发的持久生长停滞状态。鉴于衰老细胞积极分泌促炎蛋白和基质重塑蛋白，它们在老年人组织中的积累与许多衰老疾病有关。尽管对鉴定衰老的稳健标记物有着浓厚的兴趣，但衰老表型的高度异质性和动态性使这项任务变得困难。

在这项新研究中，来自国家老龄化研究所的研究人员 Noah Wechter、Martina Rossi、Carlos Anerillas、Dimitrios Tsitsipatis、Yulan Piao、Jinshui Fan、Jennifer L. Martindale、Supriyo De、Krystyna Mazan-Mamczarz 和Myriam Gorospe着手全面通过两种方法进行单细胞 RNA 测序分析，在单个细胞尺度上分析人二倍体成纤维细胞的衰老转录组。

“在这里，我们使用单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 分析来记录人类衰老成纤维细胞在单个细胞尺度上的不同转录组，以及依托泊苷引发的衰老过程中转录组随时间的变化。”

首先，研究人员描述了由不同应激引发的衰老培养物中不同细胞状态的特征，并发现了不同的细胞亚群，这些细胞亚群表达编码蛋白质的 mRNA，这些蛋白质在生长停滞、存活和分泌表型中发挥作用。其次，他们描述了细胞转录组在发生依托泊苷诱导的衰老过程中的动态变化;通过跟踪整个过程中的细胞转换，研究人员发现了两种不同的衰老程序，一种是细胞表达传统的衰老标记，如 p16 (CDKN2A) mRNA，另一种是细胞表达长链非编码 RNA，剪接失调。最后，他们获得了衰老开始时的增殖状态影响衰老路径的证据，

“我们建议，在不同衰老细胞表型的进展过程中更深入地了解转录组，将有助于开发针对这种有害细胞群的更有效的干预措施。”