加拿大首个临床RNA测序平台可改善儿科罕见病诊断

病童医院(SickKids) 的一个新的临床 RNA 测序平台正在帮助促进对罕见遗传病症的研究，并为 Precision Child Health 开辟道路，这是 SickKids 的一项运动，旨在为每位患者提供个性化护理。

RNA 测序提供了一种观察基因的不同方式，通过观察身体如何解释遗传密码，而不是直接观察遗传密码本身。虽然基因组测序等基于 DNA 的测试拍摄了一个人的遗传密码，但科学家们可以通过观察 RNA 来更好地了解 DNA 是如何被读取的，RNA 携带着在我们体内制造蛋白质的指令。

在 SickKids 研究所，科学家们在过去六年中一直密切合作，以构建 RNA 测序并将其纳入研究管道。现在，在基因组诊断部临床实验室主任 Lianna Kyriakopoulou 博士和实验室专家 Kyoko Yuki 博士的支持下，这项技术在加拿大首次得到验证，可作为一种新的技术用于临床领域精确诊断的工具。

“SickKids 的临床 RNA 测序平台正在通过以患者为中心的护理，或 SickKids 所谓的 Precision Child Health，帮助推动针对患有罕见遗传病的患者的诊断，”Lianna Kyriakopoulou 博士说。“结合使用，基因组测序和 RNA 测序可能会进一步告知哪些发现与帮助指导临床决策相关。”

结合 DNA 和 RNA 测序为复杂的遗传条件提供改进的诊断信息

使用这个临床 RNA 测序平台，SickKids 研究人员团队与布鲁克大学的 Panagiota Klentrou 博士合作，对复杂护理计划中来自 39 个不同家庭的 97 人进行了基因组测序和 RNA 测序，该临床计划侧重于诊断和治疗 。照顾患有无法解释的医学复杂性的儿童。

在《人类遗传学杂志》上发表的一项研究中 ，RNA 分析为另外 8% 的患者提供了有用的诊断信息，这些患者的诊断未通过单独的基因组测序得到证实，从而证实或排除了已鉴定 DNA 变异的影响在基因组测序期间。

“我们的研究结果表明，在一群疑似有基因诊断的儿童中，将 RNA 测序与基因组测序配对有明显的好处，”共同第一作者 Ashish Deshwar 博士解释说，他是医学遗传学和基因组学的住院医师。

这项研究也是首批检验三重方法对 RNA 测序的效用的研究之一，该过程涉及对受影响的个人和父母双方进行 RNA 测序。虽然对该人群进行的三重 RNA 测序没有发现任何新的遗传变异，但它减少了研究人员审查结果所需的时间，并提高了分析效率。

Deshwar 与其他第一作者 Yuki 和 威尔逊实验室的生物信息学家 Huayun Hou 博士一起，也注意到家庭成员之间的遗传 RNA 模式，并对它在进一步研究中的潜在用途持乐观态度。

“我们希望我们的研究结果将有助于支持将基于临床的 RNA 检测纳入罕见病儿童的诊断工作流程，”共同负责人和医师科学家 Drs 说。 Gregory Costain 和 Jim Dowling ，分别是遗传学和基因组生物学项目的科学家跟踪研究员和高级科学家 。

RNA测序平台激发了对遗传条件的新研究

该研究只是 SickKids 众多利用 RNA 测序的研究项目之一。

在 SickKids 研究所的 应用基因组学中心 (TCAG) ，由于Wilson Lab、Dowling Lab、 Costain Lab、Shlien Lab、Brudno Lab 等的协作努力，研究人员也可以使用自动筛选平台计算医学中心 (CCM)的设备和专业知识 。

目前正在进行的研究包括Thomas Eiwegger博士对过敏反应的研究 以及Linda Hiraki 博士对狼疮患者血液样本的 研究。

为 Precision Child Health 的未来搭建临床和研究桥梁

随着对 RNA 测序益处的研究越来越多，科学家和临床医生很高兴能够更好地定义临床 RNA 测序可以为患有罕见遗传病的患者以及其他患者群体提供真正见解的场景。这对于提供有关使 RNA 测序更广泛地用于精确诊断的决策所需的证据至关重要。

“我们在 SickKids 的研究和临床实验室之间建立了一座牢固的桥梁，这将有利于正在进行和未来的研究，这些研究有助于精准医学成为护理标准，也有利于整个医院的患者，”高级科学家 Michael Wilson 博士 说。遗传学和基因组生物学计划，曾担任加拿大比较基因组学研究主席。“通过对来自不同患病和健康儿童群体的 RNA 进行仔细测序和分析，我们有可能改进我们为患有罕见遗传病的患者找到诊断结果的方式。”

这项研究由加拿大基因组、SickKids 遗传医学中心、SickKids 研究所和多伦多大学 McLaughlin 中心资助。SickKids Innovators Fund 为开发 RNA 测序平台提供了额外资金。