研究人员调查住院患者大肠杆菌的多样性

人体肠道是许多细菌和其他微生物栖息的环境，统称为肠道微生物组、肠道微生物群或肠道菌群。对于大多数人来说，它有助于健康。健康的肠道意味着更强的免疫系统、改善的新陈代谢以及健康的大脑和心脏等功能。

大肠杆菌是几乎在每个人的肠道微生物群中都能发现的细菌之一，它在其中发挥着重要的功能，例如产生某些维生素。联邦大学实验性肠杆菌致病性实验室(LEPE)负责人TâniaGomesdoAmaral说：“但该物种存在大量遗传多样性。它的一些成员具有致病性，可引起尿路感染等疾病。”巴西圣保罗医学院(EPM-UNIFESP)。

“大肠杆菌是健康人和住院患者或医疗服务使用者中此类感染的主要病原体。”

Amaral是《病原体》杂志上发表的一篇文章的第一作者，该文章讲述了这些细菌的毒力及其对住院患者的抗生素耐药性。

“我们的研究主要针对住院患者，因为长期住院的患者更有可能接受各种手术，例如尿管插入或静脉通路。尽管执行这些手术是为了确保生命支持，但它们可能有助于进入细菌进入生物体并引起感染，”Amaral解释道。

她获得了博士学位。1988年在EPM-UNIFESP获得微生物学博士学位，在纽约大学医学院和美国马里兰大学巴尔的摩分校(UMB)的疫苗开发中心进行部分研究。

这篇文章报告了一项由Amaral领导的更广泛研究的结果，该研究的12名共同作者是研究人员和研究生，研究的是与尿路感染相关的大肠杆菌菌株的毒力和耐药性。

JoséFranciscoSantosNeto的硕士论文中描述了这部分研究的主要目的是评估从住院患者肠道微生物群中分离出的致病性大肠杆菌菌株的多样性和耐药性，并分析内源性感染(由患者自身微生物群中的细菌引起)。

UNIFESP小组首先调查了从住院患者肠道微生物群中分离出的大肠杆菌菌株的遗传多样性和耐药性，对这些菌株以及从他们的尿液中分离出的其他菌株进行了测序，并比较了结果，以评估细菌在患者体内的传播情况。医院环境。

“我们还将这些菌株的基因组与世界不同地区分离的大肠杆菌菌株的基因组进行了比较，以了解研究样本中是否存在任何全球传播的致病菌，”博士后AnaCarolinadeMelloSantos说。LEPE团队的研究员。

对于研究中的绝大多数患者(超过70%)，尿路感染被证明是内源性的。结果还表明，患者的肠道微生物群至少包含两个基因不同的大肠杆菌种群，并且大约30%被非乳糖发酵大肠杆菌菌株定植，这种情况不太常见，一些研究的患者他们的肠道微生物群中只有这样的菌株。

“这一发现最有趣，因为之前在其他国家进行的分析人类肠道微生物群组成的研究没有调查非乳糖发酵大肠杆菌，”桑托斯说。

作者还注意到，在所有尚未发生感染的患者的肠道微生物群中，存在具有分类为致病性所需的所有遗传标记的细菌以及检测致病性细菌。“住院患者更容易受到感染，因为根据定义，他们已经身体不适。病原体定植是医院获得性感染传播的第一步，现在在世界范围内如此频繁，”桑托斯说。

关于抗生素和其他抗菌药物，作者强调耐药性也是一个日益严重的全球性问题，肠杆菌对第三代头孢菌素和粘菌素的耐药性至关重要。在肠道微生物群被耐药细菌定植的所有患者中，相同的细菌也会引起内源性尿路感染。换句话说，多重耐药细菌在肠道定殖并传播到泌尿道，在那里它们引起了感染。

“鉴于这些发现，对住院患者的肠道微生物群进行早期评估，至少在大肠杆菌感染的情况下，可以促进和指导他们的治疗，同时还可以识别有可能发展为尿路感染等肠外疾病的患者，这是我们研究重点的一部分，”Amaral说。

“我们还不知道这些发现是否也适用于肠道微生物群中发现的其他细菌，例如克雷伯氏菌属、肠杆菌属、假单胞菌属和其他当它们移动到肠外部位时会引起感染的细菌。”

这些细菌属往往比大肠杆菌更具耐药性，代表了医院环境中的一个主要公共卫生问题。正如研究人员指出的那样，世界卫生组织(WHO)认为对头孢菌素和粘菌素具有耐药性的大肠杆菌菌株是一种严重的全球健康威胁。“人类肠道微生物群中与严重传染病相关的耐药细菌的存在是一个非常令人担忧的问题，尤其是因为它们可能传播给医院环境以外的人，”Amaral说。

该研究提出的另一点是找出患者肠道何时发生耐药性强毒菌定植的重要性。该文章的作者无法确定对头孢菌素和粘菌素具有耐药性的细菌是在患者住院之前还是之后定植的。

然而，通过分析菌株的基因组，研究人员能够识别出可能导致严重疾病并与抗菌素耐药性相关的全球风险克隆。“在两名患者的肠道微生物群中发现的一个这样的克隆与在隆德里纳、巴拉那[巴西南部的一个州]、美国以及欧洲和亚洲国家从尿路感染中分离出来的其他克隆相同。这表明研究中发现的一些菌株是通常与世界所有地区的感染相关的克隆，”Amaral说。

当患者住院时，此类信息很重要。细菌毒力和耐药性的知识可用于预防肠道外生物体部分的感染，并阻止细菌传播给同一医院的其他患者。